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2011年1月1日土曜日

新しいことを形にしていく年に

昨年の最初に,「新しい年を,背水の陣で迎える」というタイトルのエントリを書きました.そのなかで「2010年はこれから自分は何をしたいのか・すべきなのかを真剣に考える年になりそうです.」「今年は専門家としての自分のアイデンティティを確立することを目標にしたいと思います.」と書いたのですが,宣言通り昨年は,これから自分は何をしたいのか・すべきなのかを考え,そして自分のアイデンティティを見つけるためにいろいろな可能性に挑戦した年でした.

1~4月まではGCOE・PEM関連の企画の主催・お手伝いをいくつかこなしました.特に,オーガナイザーとして参加した環境機関コンソーシアム交流会では,準備の過程で多くの方に迷惑をかけ・助けてもらうことを通じて,いろいろ成長することができたかなと思っています.オーガナイザーとしては及第点には程遠かったと思いますが,イベント自体は何とか無事に終わらせることができました.また,4月には日本森林学会大会にて国際ワークショップをひとつ企画しました.これもはじめての挑戦でいろいろ大変だったのですが,国際センスをみがくうえでとてもいい経験になりました.

5~8月はD論の解析と論文書きに熱中していました.もともとほとんどのネタは学会で発表してたので,あとは図を書きなおして論文を書くだけだと思っていたのですが,論文を書くために改めて勉強してみると,これまでの解析のマズイところなどがたくさん見つかり,結局最初から解析をやり直すことになりました.また,7月に偶然,東京大学の岸野先生に論文を見ていただく機会があり,これまでほぼ独学でやってきたデータ解析のマズイところなどを丁寧に指導していただきました.査読の結果はまだ帰ってきていないのですが,何としてでもいいところに載せたいものです.

9~11月はPEMの一環としてイタリア・ローマの国際NGO「Bioversity International」でインターンシップをやってきました.仕事内容はFAOが2013年に発行する予定のレポート「State of the World's Forest Genetic Resources」のバックグラウンドとなるレビュー論文を執筆するプロジェクトのマネジメントと文献調査・プロポーザル書きなどです.幸いにもスーパーバイザーにめぐまれ,楽しく仕事をすることができました.また,多様なバックグラウンドをもった人たちがいる国際組織で働いてみて,組織マネジメントのやり方や同世代の人たちのキャリアに対する価値観など,目からウロコなことがたくさんありました.

また,夏から秋にかけて,来年度からの働き場所を探しはじめ,幸運にも最初に応募した研究機関で常勤の研究員として採用していただけることになりました.来年度からは,これまでの専門だった森林生態・保全遺伝だけでなく,生物多様性に関係する幅広い課題を扱うことになりそうです.これまでよりも環境マネジメントの現場に近いところで仕事をすることになるので,PEMで培ってきた経験が生かせればと思っています.

年末にはもう一つ,大きな決断をしました.これについては,今年の終わりくらいにでもここでご報告できればと思っています.

というわけで,昨年は自分自身の視野・能力・アイデンティティなどにとても大きな変化があった年でした.今年はそれらを少しずつ形にしていく年にできればと思っています.

2010年7月15日木曜日

保全の現場に共通するコンセプトはあるのか?

かなり長いあいだブログを書くのをサボっていました.もはや見に来ている人がいるか分かりませんが,今日はちょっと気が向いたので久しぶりにブログを更新しようと思います.最近は,博士論文を書くために保全生物学・遺伝学に関する総説論文や教科書を読みながら,自分の研究の意義についてどちらかと言えば批判的な見地から考えるということをしています.これからしばらく,読んだ論文の中から多くのみなさんに関心を持ってもらえそうなものを選んで,ここで紹介したいと思います.

第一弾として,ちょっと前に生物多様性に配慮した林業の研究などで有名なDavid LindenmayerさんがConservation Biology誌に,保全生物学に関する面白い記事を書いていたので,ここで紹介したいと思います.Lindenmayer and Hunter (2010) Some guiding concept for conservation biology. Conservation Biology, in press. doi: 10.1111/j.1523-1739.2010.01544.x.

1980年前後に,Michael Soulé,Bruce Wilcoxによって提唱されてから現在にいたるまでのわずかな数十年で,保全生物学はひとつの大きな学問領域を成すまでに成長しました.ところが,保全生物学の研究者や保全の現場に携わっている人の多くが認識している通り,保全生物学というのはその場限りの事例研究であることが多く,保全の現場に共通する知見があまり整理されてきませんでした.保全生物学は問題解決の学問なので個別の研究レベルではそれで構わないと思います.しかし,問題解決の大元になる考え方・手法などがバラバラだと,個別の取り組みが保全にとって有効であるかどうか判断ができなくなります.また,政策立案者も実際の意思決定をするときに何を基準にしていいのか分からなくなってしまいます.

この論文の筆者らは,保全の現場に共通するコンセプトとして以下の10点をあげています.また,Society of Conservation Biologyのウェブサイトではこれに関するコメント・ディスカッションを受け付けているようですので,興味のある方はぜひチェックしてもらえればと思います.

  • 1. 保全・マネジメントを成功させるためには,明確なゴールと目的が設定されていなければいけない.保全の目標は,ただ「その場所の生物多様性を保全する」というのではなく,具体的かつ測定可能でなければいけない.また,「ハビタット」「生態系」「野生動物」「閾値」「頑健性」などの用語は,たとえば「トラのハビタット」などのように具体的に定義しなければいけない.
  • 2. 生態系管理の目的は,生物多様性そのものの維持・回復であって,種数を最大化することではない.「種数」は生物多様性のマネジメントでよく使われる指標ではあるが,ある程度健全な生態系のマネジメントではこれを最大化することは適切ではない.すべての種の価値はイコールではなく,それぞれに異なった由来(在来or外来)・生態的な役割・脆弱性・経済的な価値などがあるからだ.
  • 3. 問題解決には,全体的なアプローチが必要である.生物多様性は遺伝子・種・生態系の異なるスケールで構成されているため,その管理もさまざまな時間的・空間的なスケールで行わなければいけない.特定の種と生態系全体のマネジメントは相補的に行われるべきである.また,社会経済的な要素も考慮すべきである.
  • 4. 多様なアプローチを導入することで,多様な環境を創り,失敗のリスクを軽減できる.生物多様性・生態系はとても複雑で不確実性が大きいので,自然のばらつきに収まる範囲で多様なマネジメントを行うことが現実的な解決策と言える.
  • 5. 自然のやり方を模倣することは有用であるが,万能ではない.自然撹乱を模倣することは有用であると考えられているが,きわめて複雑な撹乱レジームや大規模な撹乱を模倣することはできない.
  • 6. 状態ではなく原因に着目しよう,効果と効率を高めよう.その場しのぎの対処療法ではなく,生態系が劣化した原因を改善しなければ保全は失敗する.
  • 7. どんな種・生態系もユニークである,ある程度は.それぞれに合わせた評価・保全がなされるべきではあるけれども,特定の標徴種を抽出したり,異なる事例に共通する法則を見つけることは重要である.
  • 8. 生態系の閾値は重要であるが,すべて同じではない.生態系にはあるポイントを通りすぎると急激に状態が変化して,なかなか元に戻らなくなる「閾値」がある.ただし「閾値」に達する前にそれを予測するのは難しく,またそれらはすべての生態系に共通ではない.
  • 9. 種・生態系に致命的な影響をおよぼすのは,複数の要因の組みあせである.そして,特定の分野に偏った対策もまた種・生態系に負の影響をあたえることがありうる.
  • 10. 人間の価値観は多様で動的である.そして,それが保全への取り組みを決める.保全の取り組みが成功するか否かは,問題設定のやり方に依存する.そして,それらを決める人間の価値観は変わりやすいが,もっともコントロールしやすい.

個別の研究レベルでこれらのすべての原則をフォローすることは不可能でしょう.しかし,1.のようにもっとも基本的な要素でありながら,意外と多くの研究で論じられていない原則もあります.まずは,自分の研究の具体的なゴールは何なのか,もう少し考えてみたいと思います.

2010年3月1日月曜日

樹木の保全遺伝学を考え直す

3月になりました.今週末からしばらく出張なので,その準備に追われています.しかし,昨晩は4月にある大きなイベントの準備をしていました.

4月2日から5日にかけて筑波大学で行われる第121回日本森林学会大会で「Conservation genetics of forest trees in the era of rapid environmental changes: from descriptions to applications」というシンポジウムを,岐阜県立森林文化アカデミーの玉木一郎さんと一緒に企画することになっています.

保全遺伝学とは,「遺伝的要因による絶滅リスクを最小にする」ことを目的とする保全生物学の一分野です.また,林業などの生物資源に関わる産業の立場から付け加えるとすれば,遺伝学の技術・知見を応用して「環境変化に対して生物資源の持続的な利用を可能にする」ことを目的とする資源管理学の一分野ともいえるでしょう.

ただし,私をふくめてこれまでに樹木の保全遺伝学にかかわってきた人がどれだけ保全の現場にコミットできたかというと,おそらくきわめて低いと言えるのではないでしょうか.これまでの保全遺伝学は集団の遺伝的多様性や遺伝的多様性に影響する要因については,それなりに知見を積み重ねてきました.しかし,保全の現場にそれを応用するためには「どうすれば遺伝的多様性を守れるのか?」「遺伝的多様性をどれだけ守ればいいのか?」「そもそお遺伝的多様性を守って何になるのか?」といった疑問に保全遺伝学の研究者は答える必要があるでしょう.

これらの背景をふまえて,もうひとつのブログに樹木の保全遺伝学の現在の論点について,かなり大雑把なドラフトを書いてみました.これをベースに今月は自分の考えを整理していきたいと思います.

2010年2月24日水曜日

国際フォーラムに参加してきた

21日から24日まで,GCOE主催の国際フォーラム「Ecosytem Management Applying to Ecosystem Adaptability Science」に参加してきました.今回は一応,招待講演者・GCOE関係者とポスター発表に応募してくれた少数の研究者に参加者を限定した非公開のイベントということで内容の詳細は書かないことにしますが,このフォーラムのテーマに関連した分野の最先端をいく刺激的な話が続いて,とても有意義な時間を過ごすことができました.

今回のフォーラムの特徴は,招待講演者もオーガナイザーも若手研究者が中心だったことです.おそらく,招待講演者の大半はポスドクかAssistant Professorだったと思います.それにもかかわらず,発表内容や議論のレベルはきわめて高く,大いに刺激を受けました.ただ,慣れない英語と自分があまりフォローしていない分野の発表が多かったせいで,マトモな質問を思いつけなかったが残念でした.

また,国内からの若手の参加者ともいろいろ話をして,自分が研究に対するモチベーションや自分自身に対する自信を失っていたこと,その結果としてどんどん同年代のトップからおいていかれていることを改めて思い知らされました.もう少し気合を入れて研究に取り組まなければと,気持ちを新たにしました.

シンポジウムが終わったあとは松島にエクスカーションに行き,さらに招待講演者の一組を連れて鳴子温泉に行きました.時差ボケで眠そうでしたが,それでもいろいろお話ができたことは大きな収穫でした.声をかけてくださった方々に感謝です.

2009年12月11日金曜日

「ゲノムと生態系をつなぐ」か・・・

12月7~9日にかけて,長野県・菅平高原で行われた研究集会「ゲノムと生態系をつなぐ進化研究-環境変動・集団履歴・適応」に参加してきました.総研大の印南秀樹さん山道真人さんによるコアレセント理論の講義・実習や,20名以上の研究者によるエコゲノミクス関連の刺激的な研究発表など,盛りだくさんな3日間でした.私自身も久しぶりにこの分野の最先端の話を聞けて,大いに刺激を受けました.

今回の集会の一番の収穫は,コアレセント理論にもとづいて遺伝子の多型情報から集団のデモグラフィーや選択の履歴を推定する一連の手順と背景となる理論を理解できたことでした.これまで,教科書やセミナーなどで断片的な知識くらいは持っていたのですが,そこから実際にどうやって応用していいのかよく分かっていませんでした.それが,印南さんの丁寧なレクチャーのおかげで,基本的な部分や実際の多型データへ適用まで,だいぶ理解できたと思います.

それに続く山道さんのレクチャーでは,簡単なモデルを例にパラメータ推定の手順をわかり易く紹介してもらいました.これについては,今回届いた日本生態学会誌59(3)の連載「始めよう!エコゲノミクス」の記事「集団内変異データが語る過去:解析手法と理論的背景(その1)」に簡潔に紹介されていますので,興味がある方はそちらを参照してください.

関連研究発表では,エコゲノミクスに関連して,局所適応・遺伝構造・表現型可塑性・遺伝子発現・ゲノム構造などについて,未発表データや研究計画を含めた刺激的な議論が続きました.今回は分野外ということもあってあまり積極的に議論には加われなかったのですが,その分視野を広げてもらった気がします.自分では大した研究をしていないのですが,こうやっていろいろな人が面白いことを教えてくれるのは,ありがたいことです.

個人的に一番面白かった発表は,浜松にある東大附属水産実験所の菊地潔さんによる,フグ類の様々な形質マッピングに関連した一連のお話でした.フグという生き物の面白さはもちろんのこと,地方の実験施設の1研究室であれだけの量・質のデータを出されているというのは,同じ田舎で研究している自分にとって,とても勇気づけられるものでした.見習いたいものです.

しかし,今回の研究集会をふりかえってみて,改めて自分自身の研究はもう「分子生態学」とは言えなくなってしまったなぁと感じました.遺伝マーカーを使った親子解析の研究は5年くらい前から時代遅れになりつつありましたが,みなさんの発表を聴いて,もう完全に「分子生態学」の枠組みから外れてしまったことを実感しました.もちろん普通の(保全)生態学の研究としてはまだまだやっていけるとは思っているのですが,いずれ新しい視点や技術を取り入れていかねばです.

もしこのまま研究者を続けていくなら自分自身がどう振舞うべきか,いろいろ考えさせられる集会でした.

2009年11月2日月曜日

データとコードの発掘を

明日は東大で塩漬けにしてしていた論文の投稿に向けた打ち合わせがあるので,今日はその準備をしています.この論文,もともとは他大学の卒論生のデータ解析をお手伝いしたのをきっかけに,共著者として加わることになったのですが,他の仕事が忙しかったりでかれこれ2年以上ほとんど進捗がないまま放置していました.

これだけ仕事を放置すると,データを点検したり図を描いたりするだけでも,一苦労です.まず,昔の自分が描いたコードが読めない,ファイルのフォーマットがバラバラ,そしてなによりもデータやソースコードが見つからない…

昨日から発掘作業をはじめて,今日のお昼にようやくデータ解析ができるようになりました.データを点検して,昔の解析の不十分だったところを直して,図をきれいに描き直してとやっていたら,真夜中までかかってしまいしました.まだ頼まれた部分が完ぺきに終わったわけではないのですが,論文の構成に関しても打ち合わせなければいけないので,これから必要な論文をチェックせねばです.アウトラインは東京に行く新幹線の中で考えることになるでしょうか.

ここ最近,いろいろな仕事がたまっていて,毎日締め切りに追われるように生きています.時間管理がなっていないというのは分かっているのですが,なかなかうまくいかないものです.

2009年10月23日金曜日

やることが・・・

今月に入ってから,仕事の量が増えてきました.その多くは夏ごろから予想していたものだったのですが,いざいろいろな種類の仕事が一度にやってくると,何から手をつけてよいのか分からなくなってしまいます.時間管理というのはむずかしいですね.

とりあえず先週は,研究室セミナーの準備,もろもろの打ち合わせ,それにマレーシア実習のレポート書きで終わってしまいました.実習のレポートについては,当初はブログに実習レポートの下書きを書いておいて,それをコピペして提出しようと思っていました.ところが,ブログを書く段階でかなりの時間を使ってしまったので,結局週末に追いつめられて書くハメになってしまいました.そのせいで,グループワークのレポートを他の人に校閲してもらう時間がなくなってしまったのは申し訳なかったです.

個人のレポートについては,加筆・修正したうえで近いうちにここで公開したいと思います.

今週は,来週の木曜日に統計数理研究所で開かれる研究集会の準備を主にやっています.当初はせいぜい10人くらいのこじんまりとした集まりだと思っていたのですが,送られてきた案内をみるとなんと30人以上の方が来られるようです.聴衆の専門分野も遺伝・進化・生理・生態からモデリング・統計数理まで幅広いので,どういう話をしたらいいものか,よいイメージが浮かびません.準備に使える時間はあと3日なので,明日からは集中して取り組みたいと思います.

それに加えて,来年3月に行われる生態適応GCOEの環境機関コンソーシアム定例会に付随して行われる,RAポスターセッション+キャリアパスイベントの準備にも取りかかりました.“上”の意向でこのイベントの一部をGCOEのRAが企画することになったので,その立ち上げを私が担当しています.先週は,仙台で“上”と事前打ち合わせしたうえで,RA実行委員候補への呼びかけを行いました.来週の水曜日には,RA実行委員会のキックオフミーティングを行う予定です.

今日は,来週のキックオフミーティングのアジェンダの素案を作って,“上”と一部のRAに送りました.来週の月曜にはすべての参加者にアジェンダを送る予定です.イベントの企画はまったくの素人なので,イベント企画ブログや会議術のサイトなどを参考にやってます.勉強になるのはいいのですが,これに時間をとられすぎるのは痛いです.

もっとも,私が事務的なことの大半をやらなければいけないのは立ち上げのときだけで,次回以降はRA実行委員のみなさんにいろいろな仕事を分担してやってもらおうと思っています.そのためにも,初回はそれなりのものを作らねばです.

さらに来週は,もう一つとても重要な打ち合わせがあります.これについては,打ち合わせまでに重たい宿題が課せられているのですが,さてどうしたものか…

そういえば,今週末のTOEICを受ける予定だったのを,今まですっかり忘れていました.もうすっぽかしてしまいたいです.

再来週は共著論文の打ち合わせとその準備,そして自分のD論プロジェクトを進めるうえでの締め切りがあります.

やることはたくさん,しかし時間は有限.しかも自分のアタマがマトモに働く時間に限定すれば,使える時間はかなり限られています.こうやってやることを書きだして,あとは無理をしようないように着々とやっていくだけです.それがうまくできないから,困ってるんですけどね.学位をとるまでには,もうちょっと時間管理がうまくなっているようになりたいものです.

2009年9月11日金曜日

街の灯りが

一昨日は,横浜国立大学へ行ってきました.以前からずっと遊びに行きたいと思っていたのですが,知人が今月いっぱいで異動してしまうとのことだったので,2週間くらい前に急きょ行くことになりました.突然の訪問だったにもかかわらず対応してくださった皆さまに感謝です.

横国大ではまず,来年4月に筑波で行われる森林学会で企画することになったシンポジウムの打ち合わせをしました.「保全遺伝」というキーワードが先にあっただけで具体的なアイディアがほとんどなかったのですが,3人であれこれアイディアを出して,最終的には面白そうな企画になったと思います.週末までにプロポーザルを仕上げて,来週の前半には候補の方々に講演依頼を出したいと思います.

打ち合わせのあとは,玉木さんと私でセミナーをさせていただきました.夏休み中で,しかも集中講義があったにもかかわらず,20人くらいの方が集まってくださいました.いろいろと面白い質問もいただき,とても有意義な時間を過ごすことができました.

セミナーのあとは,新横浜で懇親会を開いていただきました.ここでもいろいろな話で盛りあがったのですが,あまりに盛り上がりすぎて夜行バスを逃してしまったのは失敗でした.横浜と東京が意外と遠いということを,痛感しました.この件では多くの方にご心配をおかけしてしまい,反省しています.

ちなみにバスを乗り過ごしたあとは,御徒町のいつも利用しているカプセルホテルで一泊して,翌朝の始発の新幹線で仙台へ戻りました.ちゃんとした布団で寝れてお風呂にも入れたので,夜行バスで帰るよりもよかったのかなと,ポジティブに考えることにしたいと思います.

2009年7月29日水曜日

リスとの攻防

今日は早池峰山のアカエゾマツ孤立個体群へ行ってきました.4年ぶりにアカエゾマツがまとまって開花したという情報を受けて急きょ様子を見に行ったのですが,下から見上げただけではどれくらい開花しているのかまではよく分かりませんでした.

それでも,何本かの木の根元にはリスが未成熟の球果を喰い散らかした跡が残っていて,それなりに結実が期待できそうだということは分かりました.秋に採取するサンプルが減ってしまうのは気がかりですが,とりあえずこれで今年の秋もいくらかはデータがとれそうで一安心です.

それにしても,どうしてリスは成熟する前に球果を食べてしまうのでしょうか.それは多分,アカエゾマツをはじめとするトウヒの類は受精直後から球果が肥大し始めて,この時期にはもう種子が成熟したものと同じくらいの大きさになっているからだと思います.むしろリスにしてみれば,未熟でやわらかい今の時期のほうが食べごろなのかも知れませんね.

しかし,貴重なサンプルを食べられてしまったほうは,このまま指をくわえて見ているわけにはいきません.そこでこちらは,リスが誤って落としてした食べられていない球果を拾い集めることにしました.この時期に落ちた球果の種子が成熟することはありませんが,中の胚はまだ生きています.これを解析することで,発生の初期段階と後期段階における近交弱勢の強さをそれぞれ推定できればいいかなと,漠然と考えています.

調査はいつもよりもだいぶ早く,3時前には終わりました.心配していた雨も大したことなく,久しぶりに山を歩けていいリフレッシュになりました.やはり生態学者はたまにはフィールドにでなきゃダメですね.

2009年7月28日火曜日

調査の前に

先週末に共同研究者の方から,早池峰山のアカエゾマツが開花したとの知らせをいただいたので,明日は急きょ調査地まで行くことになりました.今年はフィールド調査をする予定がなく油断していたので,明日の準備に手間取っています.何かまた忘れものをしそうで,心配です.

明日は開花状況の下見ということなので,調査地の見回りとサンプリングの段取りの相談になるかと思います.なので,体力的にキツイ仕事にはならないと思うのですが,午後から雨の予報が出ているのは気がかりです.どうか,あまり激しい雨にならないことを祈るばかりです.

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ところで,このブログに移ってから日記を書く頻度がやや減りました.理由は,従来の散漫なスタイルをやめて,他の人に見せることを意識した文章を書こうとするあまり,日常の些細な出来事を書きづらくなったからです.

あわせて,ここでレビューしたい時事ネタや本もいくつかあるのですが,今週は忙しくてまとまった時間がとれませんでした.週末までにはレビューを一つくらいは書きたいと思っています.